El Patronato de EOI es el órgano de gobierno y representación de la Fundación EOI, al que corresponde la obligación de cumplir los fines fundacionales y administrar los bienes y derechos que integran el patrimonio de EOI. La composición del Patronato viene determinada por los Estatutos de EOI.

En la actualidad son miembros del Patronato, agrupados según el carácter de su condición, los siguientes:

Patronos natos

• Presidente: Subsecretario de Industria, Turismo y Comercio.
   
• Vicepresidente Primero: Secretario General Técnico del Ministerio de Industria, Turismo y Comercio.
   
• Director General de la Oficina Española de Patentes y Marcas.
   
• Jefe del Gabinete Técnico de la Subsecretaría de Industria, Turismo y Comercio.
   

Patronos en representación del sector público

• Director General del Instituto para la Diversificación y el Ahorro de la Energía (IDAE).
   
• Director General de Red.es.